Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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