Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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