Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRPF4BQ13523 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms