Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms