Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXE3Q13461 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXE3Q13461 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXE3Q13461 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXE3Q13461 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXE3Q13461 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXE3Q13461 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXE3Q13461 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXE3Q13461 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXE3Q13461 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXE3Q13461 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXE3Q13461 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FOXE3Q13461 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXE3Q13461 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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FOXE3Q13461 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXE3Q13461 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXE3Q13461 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
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FOXE3Q13461 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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FOXE3Q13461 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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FOXE3Q13461 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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FOXE3Q13461 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXE3Q13461 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXE3Q13461 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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FOXE3Q13461 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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FOXE3Q13461 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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FOXE3Q13461 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXE3Q13461 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXE3Q13461 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXE3Q13461 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FOXE3Q13461 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXE3Q13461 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXE3Q13461 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FOXE3Q13461 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXE3Q13461 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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FOXE3Q13461 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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FOXE3Q13461 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXE3Q13461 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXE3Q13461 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXE3Q13461 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXE3Q13461 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXE3Q13461 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXE3Q13461 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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