Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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