Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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