Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
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