Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TWF1Q12792 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TWF1Q12792 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TWF1Q12792 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TWF1Q12792 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TWF1Q12792 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
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TWF1Q12792 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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TWF1Q12792 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
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TWF1Q12792 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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