Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ARHGEF5Q12774 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF5Q12774 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
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