Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RASGEF1BQ0VAM2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms