Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms