Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms