Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms