Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms