Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms