Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
XPCQ01831 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPCQ01831 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPCQ01831 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
XPCQ01831 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
XPCQ01831 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPCQ01831 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPCQ01831 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPCQ01831 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPCQ01831 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPCQ01831 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPCQ01831 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPCQ01831 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPCQ01831 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPCQ01831 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XPCQ01831 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XPCQ01831 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XPCQ01831 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XPCQ01831 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XPCQ01831 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XPCQ01831 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
XPCQ01831 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XPCQ01831 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XPCQ01831 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
XPCQ01831 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
XPCQ01831 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
XPCQ01831 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
XPCQ01831 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
XPCQ01831 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XPCQ01831 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
XPCQ01831 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XPCQ01831 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
XPCQ01831 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
XPCQ01831 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
XPCQ01831 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
XPCQ01831 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
XPCQ01831 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
XPCQ01831 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
XPCQ01831 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
XPCQ01831 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
XPCQ01831 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
XPCQ01831 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
XPCQ01831 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
XPCQ01831 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
XPCQ01831 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPCQ01831 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPCQ01831 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPCQ01831 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPCQ01831 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPCQ01831 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPCQ01831 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPCQ01831 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPCQ01831 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPCQ01831 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPCQ01831 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPCQ01831 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPCQ01831 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPCQ01831 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPCQ01831 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPCQ01831 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPCQ01831 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPCQ01831 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPCQ01831 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XPCQ01831 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XPCQ01831 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XPCQ01831 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XPCQ01831 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XPCQ01831 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XPCQ01831 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
XPCQ01831 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
XPCQ01831 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
XPCQ01831 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
XPCQ01831 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
XPCQ01831 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XPCQ01831 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
XPCQ01831 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XPCQ01831 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
XPCQ01831 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XPCQ01831 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XPCQ01831 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
XPCQ01831 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
XPCQ01831 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
XPCQ01831 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
XPCQ01831 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
XPCQ01831 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
XPCQ01831 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
XPCQ01831 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
XPCQ01831 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
XPCQ01831 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
XPCQ01831 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
XPCQ01831 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
XPCQ01831 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
XPCQ01831 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
XPCQ01831 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
XPCQ01831 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
XPCQ01831 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
XPCQ01831 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
XPCQ01831 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
XPCQ01831 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XPCQ01831 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms