Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms