Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms