Protein–RNA interactions for Protein: Q00796

SORD, Sorbitol dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORDQ00796 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SORDQ00796 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SORDQ00796 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SORDQ00796 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SORDQ00796 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SORDQ00796 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SORDQ00796 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SORDQ00796 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORDQ00796 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORDQ00796 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORDQ00796 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORDQ00796 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORDQ00796 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORDQ00796 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORDQ00796 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORDQ00796 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORDQ00796 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORDQ00796 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORDQ00796 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORDQ00796 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORDQ00796 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORDQ00796 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORDQ00796 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORDQ00796 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORDQ00796 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORDQ00796 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORDQ00796 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORDQ00796 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SORDQ00796 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORDQ00796 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SORDQ00796 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORDQ00796 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms