Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCCQ00597 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms