Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms