Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CRB1P82279 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRB1P82279 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRB1P82279 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRB1P82279 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRB1P82279 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRB1P82279 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRB1P82279 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRB1P82279 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRB1P82279 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRB1P82279 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRB1P82279 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRB1P82279 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRB1P82279 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRB1P82279 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CRB1P82279 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRB1P82279 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRB1P82279 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRB1P82279 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRB1P82279 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRB1P82279 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRB1P82279 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRB1P82279 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRB1P82279 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRB1P82279 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRB1P82279 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRB1P82279 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRB1P82279 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CRB1P82279 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRB1P82279 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRB1P82279 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRB1P82279 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRB1P82279 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRB1P82279 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRB1P82279 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRB1P82279 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRB1P82279 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRB1P82279 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRB1P82279 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CRB1P82279 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRB1P82279 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRB1P82279 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRB1P82279 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRB1P82279 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRB1P82279 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CRB1P82279 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRB1P82279 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRB1P82279 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRB1P82279 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRB1P82279 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRB1P82279 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRB1P82279 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRB1P82279 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRB1P82279 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRB1P82279 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRB1P82279 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRB1P82279 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRB1P82279 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRB1P82279 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRB1P82279 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRB1P82279 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRB1P82279 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRB1P82279 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRB1P82279 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRB1P82279 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRB1P82279 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRB1P82279 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRB1P82279 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRB1P82279 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRB1P82279 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRB1P82279 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRB1P82279 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CRB1P82279 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRB1P82279 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRB1P82279 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRB1P82279 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRB1P82279 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRB1P82279 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRB1P82279 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRB1P82279 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRB1P82279 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRB1P82279 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRB1P82279 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRB1P82279 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRB1P82279 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRB1P82279 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRB1P82279 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRB1P82279 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRB1P82279 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRB1P82279 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRB1P82279 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRB1P82279 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CRB1P82279 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRB1P82279 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRB1P82279 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRB1P82279 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRB1P82279 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRB1P82279 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRB1P82279 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRB1P82279 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms