Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HBBP68871 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HBBP68871 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HBBP68871 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HBBP68871 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HBBP68871 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HBBP68871 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HBBP68871 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HBBP68871 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HBBP68871 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HBBP68871 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HBBP68871 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HBBP68871 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HBBP68871 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HBBP68871 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HBBP68871 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HBBP68871 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HBBP68871 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HBBP68871 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HBBP68871 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HBBP68871 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HBBP68871 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HBBP68871 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HBBP68871 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HBBP68871 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HBBP68871 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HBBP68871 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HBBP68871 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HBBP68871 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HBBP68871 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HBBP68871 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HBBP68871 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms