Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-24P63145 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms