Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCS1P62166 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCS1P62166 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCS1P62166 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCS1P62166 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCS1P62166 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCS1P62166 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCS1P62166 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCS1P62166 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCS1P62166 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCS1P62166 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCS1P62166 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCS1P62166 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCS1P62166 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCS1P62166 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCS1P62166 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCS1P62166 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCS1P62166 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCS1P62166 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NCS1P62166 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCS1P62166 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCS1P62166 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCS1P62166 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCS1P62166 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCS1P62166 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCS1P62166 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCS1P62166 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCS1P62166 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCS1P62166 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCS1P62166 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCS1P62166 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCS1P62166 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCS1P62166 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCS1P62166 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCS1P62166 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCS1P62166 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCS1P62166 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCS1P62166 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms