Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFM1P61960 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UFM1P61960 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UFM1P61960 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UFM1P61960 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UFM1P61960 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UFM1P61960 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UFM1P61960 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UFM1P61960 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UFM1P61960 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UFM1P61960 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UFM1P61960 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UFM1P61960 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UFM1P61960 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UFM1P61960 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UFM1P61960 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UFM1P61960 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UFM1P61960 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UFM1P61960 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UFM1P61960 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UFM1P61960 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UFM1P61960 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UFM1P61960 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UFM1P61960 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UFM1P61960 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UFM1P61960 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UFM1P61960 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UFM1P61960 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UFM1P61960 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFM1P61960 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFM1P61960 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFM1P61960 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFM1P61960 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFM1P61960 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFM1P61960 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFM1P61960 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFM1P61960 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFM1P61960 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFM1P61960 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFM1P61960 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFM1P61960 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFM1P61960 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UFM1P61960 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UFM1P61960 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFM1P61960 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UFM1P61960 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFM1P61960 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFM1P61960 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFM1P61960 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFM1P61960 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFM1P61960 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFM1P61960 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFM1P61960 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFM1P61960 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFM1P61960 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFM1P61960 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFM1P61960 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFM1P61960 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UFM1P61960 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UFM1P61960 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UFM1P61960 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UFM1P61960 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UFM1P61960 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UFM1P61960 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UFM1P61960 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UFM1P61960 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UFM1P61960 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UFM1P61960 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms