Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms