Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCD1P59942 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms