Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN15P56746 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms