Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTCP1P56278 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms