Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC12A2P55011 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms