Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms