Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms