Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms