Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP4P49662 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP4P49662 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP4P49662 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP4P49662 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP4P49662 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP4P49662 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP4P49662 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP4P49662 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP4P49662 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP4P49662 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP4P49662 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP4P49662 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP4P49662 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP4P49662 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP4P49662 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP4P49662 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP4P49662 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP4P49662 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP4P49662 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP4P49662 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP4P49662 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP4P49662 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP4P49662 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP4P49662 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP4P49662 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP4P49662 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP4P49662 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP4P49662 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP4P49662 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP4P49662 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP4P49662 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP4P49662 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP4P49662 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP4P49662 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP4P49662 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP4P49662 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP4P49662 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP4P49662 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP4P49662 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP4P49662 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP4P49662 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP4P49662 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP4P49662 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP4P49662 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP4P49662 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP4P49662 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP4P49662 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP4P49662 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP4P49662 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP4P49662 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP4P49662 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP4P49662 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP4P49662 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP4P49662 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP4P49662 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP4P49662 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP4P49662 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP4P49662 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP4P49662 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP4P49662 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP4P49662 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP4P49662 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP4P49662 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP4P49662 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP4P49662 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP4P49662 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP4P49662 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP4P49662 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP4P49662 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP4P49662 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP4P49662 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP4P49662 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP4P49662 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP4P49662 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP4P49662 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP4P49662 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP4P49662 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP4P49662 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP4P49662 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP4P49662 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP4P49662 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP4P49662 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP4P49662 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP4P49662 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP4P49662 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP4P49662 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP4P49662 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP4P49662 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP4P49662 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP4P49662 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP4P49662 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP4P49662 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP4P49662 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP4P49662 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP4P49662 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASP4P49662 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASP4P49662 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASP4P49662 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASP4P49662 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms