Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms