Protein–RNA interactions for Protein: P46108

CRK, Adapter molecule crk, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRKP46108 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRKP46108 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CRKP46108 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRKP46108 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CRKP46108 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CRKP46108 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRKP46108 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRKP46108 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRKP46108 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CRKP46108 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRKP46108 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRKP46108 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRKP46108 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRKP46108 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRKP46108 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRKP46108 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRKP46108 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRKP46108 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRKP46108 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRKP46108 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRKP46108 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CRKP46108 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRKP46108 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRKP46108 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRKP46108 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRKP46108 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKP46108 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKP46108 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKP46108 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKP46108 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKP46108 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKP46108 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKP46108 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKP46108 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKP46108 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKP46108 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKP46108 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKP46108 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKP46108 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKP46108 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKP46108 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKP46108 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKP46108 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKP46108 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKP46108 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKP46108 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKP46108 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKP46108 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKP46108 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKP46108 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKP46108 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKP46108 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKP46108 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKP46108 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKP46108 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKP46108 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKP46108 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKP46108 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKP46108 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKP46108 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKP46108 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKP46108 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKP46108 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKP46108 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKP46108 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKP46108 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKP46108 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKP46108 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKP46108 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKP46108 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKP46108 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKP46108 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKP46108 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKP46108 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKP46108 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKP46108 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKP46108 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKP46108 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKP46108 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKP46108 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKP46108 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKP46108 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKP46108 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKP46108 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKP46108 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKP46108 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKP46108 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKP46108 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKP46108 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKP46108 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKP46108 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKP46108 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKP46108 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKP46108 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKP46108 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKP46108 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKP46108 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKP46108 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRKP46108 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRKP46108 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms