Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPD2P43304 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPD2P43304 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GPD2P43304 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GPD2P43304 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPD2P43304 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPD2P43304 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPD2P43304 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPD2P43304 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPD2P43304 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPD2P43304 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPD2P43304 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GPD2P43304 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPD2P43304 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPD2P43304 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPD2P43304 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPD2P43304 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPD2P43304 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPD2P43304 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPD2P43304 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPD2P43304 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPD2P43304 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPD2P43304 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPD2P43304 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPD2P43304 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPD2P43304 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPD2P43304 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPD2P43304 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPD2P43304 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPD2P43304 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPD2P43304 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPD2P43304 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPD2P43304 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPD2P43304 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPD2P43304 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPD2P43304 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPD2P43304 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPD2P43304 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPD2P43304 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPD2P43304 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPD2P43304 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPD2P43304 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPD2P43304 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GPD2P43304 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPD2P43304 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPD2P43304 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPD2P43304 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GPD2P43304 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPD2P43304 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPD2P43304 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPD2P43304 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPD2P43304 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPD2P43304 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPD2P43304 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPD2P43304 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPD2P43304 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPD2P43304 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPD2P43304 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPD2P43304 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPD2P43304 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPD2P43304 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPD2P43304 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPD2P43304 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPD2P43304 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPD2P43304 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPD2P43304 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPD2P43304 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPD2P43304 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPD2P43304 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GPD2P43304 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPD2P43304 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPD2P43304 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPD2P43304 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPD2P43304 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPD2P43304 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPD2P43304 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPD2P43304 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPD2P43304 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPD2P43304 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPD2P43304 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GPD2P43304 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPD2P43304 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPD2P43304 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GPD2P43304 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GPD2P43304 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPD2P43304 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPD2P43304 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPD2P43304 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPD2P43304 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GPD2P43304 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPD2P43304 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPD2P43304 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPD2P43304 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPD2P43304 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPD2P43304 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPD2P43304 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPD2P43304 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GPD2P43304 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPD2P43304 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPD2P43304 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms