Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJC1P36383 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJC1P36383 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJC1P36383 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJC1P36383 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJC1P36383 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJC1P36383 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJC1P36383 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJC1P36383 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJC1P36383 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GJC1P36383 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJC1P36383 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJC1P36383 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJC1P36383 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GJC1P36383 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJC1P36383 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJC1P36383 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJC1P36383 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJC1P36383 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJC1P36383 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJC1P36383 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJC1P36383 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJC1P36383 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GJC1P36383 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GJC1P36383 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJC1P36383 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJC1P36383 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJC1P36383 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJC1P36383 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJC1P36383 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJC1P36383 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJC1P36383 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJC1P36383 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJC1P36383 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJC1P36383 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJC1P36383 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJC1P36383 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJC1P36383 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJC1P36383 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJC1P36383 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJC1P36383 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJC1P36383 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJC1P36383 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GJC1P36383 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJC1P36383 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJC1P36383 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJC1P36383 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJC1P36383 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJC1P36383 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJC1P36383 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJC1P36383 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJC1P36383 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJC1P36383 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJC1P36383 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJC1P36383 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJC1P36383 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJC1P36383 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJC1P36383 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJC1P36383 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJC1P36383 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJC1P36383 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJC1P36383 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJC1P36383 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJC1P36383 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJC1P36383 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJC1P36383 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJC1P36383 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJC1P36383 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJC1P36383 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJC1P36383 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJC1P36383 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJC1P36383 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJC1P36383 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJC1P36383 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJC1P36383 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJC1P36383 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJC1P36383 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJC1P36383 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJC1P36383 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJC1P36383 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJC1P36383 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJC1P36383 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJC1P36383 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJC1P36383 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJC1P36383 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJC1P36383 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJC1P36383 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJC1P36383 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJC1P36383 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJC1P36383 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms