Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA3P32297 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA3P32297 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA3P32297 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA3P32297 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA3P32297 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA3P32297 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA3P32297 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA3P32297 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA3P32297 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA3P32297 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA3P32297 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA3P32297 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA3P32297 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA3P32297 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA3P32297 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA3P32297 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA3P32297 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA3P32297 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA3P32297 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA3P32297 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA3P32297 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA3P32297 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA3P32297 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA3P32297 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA3P32297 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRNA3P32297 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRNA3P32297 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRNA3P32297 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA3P32297 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms