Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA7P31268 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms