Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC27P30260 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC27P30260 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC27P30260 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC27P30260 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC27P30260 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC27P30260 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC27P30260 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC27P30260 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC27P30260 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC27P30260 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC27P30260 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC27P30260 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC27P30260 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC27P30260 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC27P30260 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC27P30260 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC27P30260 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC27P30260 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC27P30260 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC27P30260 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC27P30260 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC27P30260 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC27P30260 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC27P30260 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC27P30260 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC27P30260 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC27P30260 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC27P30260 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC27P30260 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC27P30260 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC27P30260 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC27P30260 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC27P30260 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC27P30260 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC27P30260 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC27P30260 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC27P30260 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC27P30260 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC27P30260 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC27P30260 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC27P30260 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC27P30260 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC27P30260 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC27P30260 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC27P30260 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC27P30260 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC27P30260 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC27P30260 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC27P30260 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC27P30260 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC27P30260 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC27P30260 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC27P30260 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC27P30260 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC27P30260 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC27P30260 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC27P30260 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC27P30260 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC27P30260 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC27P30260 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC27P30260 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC27P30260 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC27P30260 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC27P30260 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC27P30260 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC27P30260 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC27P30260 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC27P30260 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC27P30260 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC27P30260 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC27P30260 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC27P30260 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC27P30260 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC27P30260 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC27P30260 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC27P30260 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC27P30260 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC27P30260 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC27P30260 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC27P30260 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC27P30260 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC27P30260 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC27P30260 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC27P30260 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC27P30260 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC27P30260 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC27P30260 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC27P30260 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC27P30260 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC27P30260 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC27P30260 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC27P30260 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC27P30260 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC27P30260 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC27P30260 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC27P30260 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC27P30260 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC27P30260 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC27P30260 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms