Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CMPK1P30085 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms