Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms