Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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