Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LOXP28300 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LOXP28300 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXP28300 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXP28300 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXP28300 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXP28300 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXP28300 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXP28300 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXP28300 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXP28300 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXP28300 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXP28300 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXP28300 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms