Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSSP25774 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSSP25774 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSSP25774 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSSP25774 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSSP25774 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSSP25774 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSSP25774 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSSP25774 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSSP25774 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSSP25774 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSSP25774 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSSP25774 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSSP25774 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSSP25774 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSSP25774 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSSP25774 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSSP25774 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSSP25774 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSSP25774 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSSP25774 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSSP25774 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTSSP25774 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTSSP25774 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTSSP25774 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTSSP25774 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTSSP25774 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSSP25774 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSSP25774 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSSP25774 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSSP25774 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSSP25774 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSSP25774 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSSP25774 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSSP25774 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSSP25774 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSSP25774 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSSP25774 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSSP25774 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSSP25774 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSSP25774 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSSP25774 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSSP25774 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSSP25774 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSSP25774 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSSP25774 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSSP25774 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSSP25774 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSSP25774 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSSP25774 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSSP25774 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSSP25774 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSSP25774 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSSP25774 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSSP25774 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSSP25774 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSSP25774 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTSSP25774 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms