Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms