Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms